В системе профилактических мер менингококковой инфекции решающее значение имеет ранняя изоляция больного или бактерионосителя. Больных с менингококцемией и гнойным менингитом немедленно госпитализируют. О каждом случае заболевания подается экстренное извещение в санитарно-эпидемиологическую станцию. В коллективы, где выявлены случаи заболевания, на протяжении 10 дней не принимаются новые лица и временно отсутствовавшие, запрещаются переводы детей из группы в группу. Проводят бактериологическое обследование контактных лиц. Бактерионосителей и больных назофарингитом изолируют и подвергают санации сульфаниламидными препаратами в течение 3 дней. Дети, переболевшие менингококковой инфекцией, и носители менингококка могут быть допущены в детский коллектив после двукратного отрицательного бактериологического обследования с интервалом 1-2 дня, начатого не раньше чем через 3 дня после окончания лечения.
Важное значение имеют общие гигиенические мероприятия (разукрупнение детских коллективов, частое проветривание помещений, обработка предметов обихода хлорсодержащими растворами, ультрафиолетовое облучение воздуха, кипячение игрушек, посуды и др.).
Вопрос об эффективности гаммаглобулинопрофилактики нуждается в дополнительном изучении.
Для создания активного иммунитета предлагаются различные живые и убитые менингококковые вакцины. Результаты по испытанию этих вакцин противоречивы. В настоящее время проходят испытание вакцины из полисахаридных антигенов. Получены обнадеживающие результаты.